测土配方项目是系统工程，在美国推广成熟用了30年时间。我国现阶段，项目推广所面对的农民的状况不容乐观。有知识、有能力的劳动力外出打工，种地农民的素质和科技水平太低，这是最大的困难。
一种新技术推广，被推广对象的惯性很难纠正。比如,农民施肥过量尤其是氮肥过量问题，就很难解决。有不少农民本来种一亩三分地，用一袋半肥料就够了，可是他们嫌存放剩余半袋麻烦，索性全部施进去。还有的农民觉得化肥好用，就尽量多用，即使农技人员告诉他要减量施肥，他当面听，农技人员一走他又施进去了。这种现象，在果蔬种植区尤其严重。这需要长期做工作，做示范，做教育。
其次，施肥结构不合理。很多农民认为尿素好就使劲上尿素，有的认为二胺好就多上二胺，很难接受新肥料。重氮肥，轻钾肥，重化肥，轻有机肥，都是不科学的。
第三，施肥方式比较落后。因为壮劳力缺乏。农业机械不够。很多农民还是采用大水漫灌浇地。化肥撒施非常普遍。特别是玉米喇叭口期的追肥。有的农民还是进行“一炮轰”，即底肥施足，不再追肥，这样做既造成跑肥，又使作物前期疯长后期缺肥。